债券的交易与股票有所不同。首先是报价的不同。企业债券的报价是以人民币1000元面额为1手。买卖以 1手或其整数倍进行申报。单笔申报最大数量应当低于1万手(含1万手)。以“每百元面值的价格”进行申报。其次是涨跌幅限制的不同。交易所对股票、基金交易实行价格涨跌幅限制，但对企业债券不设涨跌幅限制。但在交易方式上，企业债券与股票一样，目前不能进行T＋0回转交易，即当天买入的企业债券当天不能卖出，第二天以后才能卖出。
企业债券交易一般也采用电脑集合竞价和连续竞价两种方式。集合竞价是指对一段时间内接受的买卖申报一次性集中撮合的竞价方式。连续竞价是指对买卖申报逐笔连续撮合的竞价方式。目前上海证券交易所企业债上市首日9：15分至9：30分采用集合竞价，之后采用连续竞价，次日以后仅进行连续竞价。深交所企业债券的交易按下列方法确定有效竞价范围：(1 )上市首日集合竞价的有效竞价范围为发行价的上下150元，连续竞价的有效竞价范围为最近成交价的上下15元；(2)非上市首日集合竞价的有效竞价范围为前收盘价的上下5元， 连续竞价的有效竞价范围为最近成交价的上下5元。深交所认为必要时，可以调整有效竞价范围并公告。 其中，若在集合竞价期间没有产生成交的，按下列方式调整有效竞价范围：(1 )有效竞价范围内的最高买入申报价高于发行价的，以最高买入申报价为基准调整有效竞价范围；(2)有效竞价范围内的最低卖出申报价低于发行价的， 以最低卖出申报价为基准调整有效竞价范围。
目前在交易所上市的企业债都是实名制记帐式债券，从交易方式上来看与股票交易和记帐式国债交易有所不同，但与实物国债的交易方式基本一致。对于二级市场的投资人来说，企业债交易与股票交易最大的不同是，企业债二级市场投资者必须遵循“在某个营业部买入只能在该营业部卖出或到期兑付本息”的原则。因此，投资者在买入企业债后，应妥善保管好该营业部给自己开具的交割单或代保管凭证，以便今后抛售或兑付。对于发行时购买的投资人来说，上市后也应该到原购买网点抛售。
另外，自2001年中移动企业债发行以后，个人投资者投资企业债都需缴纳20％的利息税。
